Альфа-тубулін, ізоформа 1b

Альфа-тубулін, ізоформа 1b
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2E4H, 4TV8, 3RYI, 3JAR, 4TUY, 4TV9, 4YJ2, 3RYH, 3JAK, 3JAS, 4F61, 3UT5, 4O4J, 4YJ3, 4EB6, 4WBN, 3JAW, 4O2A, 3RYF, 3JAL, 4O4H, 4LNU, 3J8Y, 4IIJ, 4O4I, 3RYC, 4O4L, 4O2B, 4I50, 3JAT, 4HNA, 4F6R, 3J8X, 5CA0, 5ITZ, 5JQG, 5IJ0, 5FNV, 5IJ9
Ідентифікатори
Символи	TUBA1B, K-ALPHA-1, tubulin alpha 1b
Зовнішні ІД	OMIM: 602530 MGI: 107804 HomoloGene: 134527 GeneCards: TUBA1B
Реагує на сполуку
velban, Іксабепілон, plinabulin, vinblastine sulfate, patupilone, vincristine sulfate, dolastatin 10
Онтологія гена Молекулярна функція • зв'язування з нуклеотидами • зв'язування з ГТФ • structural molecule activity • structural constituent of cytoskeleton • GO:0001948, GO:0016582 зв’язування з білками плазми • GO:0006184 GTPase activity • double-stranded RNA binding • зв'язування з убіквітинпротеїнлігазою Клітинна компонента • цитоплазма • myelin sheath • cytoplasmic microtubule • мікротрубочка • цитоскелет • microtubule cytoskeleton • membrane raft Біологічний процес • cellular response to interleukin-4 • cytoskeleton-dependent intracellular transport • поділ клітини • microtubule-based process • microtubule cytoskeleton organization • GO:0007067 мітоз Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	10376	22143
Ensembl	ENSG00000123416	ENSMUSG00000023004
UniProt	P68363	P05213
RefSeq (мРНК)	NM_006082	NM_011654
RefSeq (білок)	NP_006073	NP_035784
Локус (UCSC)	Хр. 12: 49.13 – 49.13 Mb	Хр. 15: 98.83 – 98.83 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Альфа-тубулін, ізоформа 1b (англ. Tubulin alpha 1b) – білок, який кодується геном TUBA1B, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 451 амінокислот, а молекулярна маса — 50 152.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MRECISIHVG		QAGVQIGNAC		WELYCLEHGI		QPDGQMPSDK		TIGGGDDSFN
TFFSETGAGK		HVPRAVFVDL		EPTVIDEVRT		GTYRQLFHPE		QLITGKEDAA
NNYARGHYTI		GKEIIDLVLD		RIRKLADQCT		GLQGFLVFHS		FGGGTGSGFT
SLLMERLSVD		YGKKSKLEFS		IYPAPQVSTA		VVEPYNSILT		THTTLEHSDC
AFMVDNEAIY		DICRRNLDIE		RPTYTNLNRL		ISQIVSSITA		SLRFDGALNV
DLTEFQTNLV		PYPRIHFPLA		TYAPVISAEK		AYHEQLSVAE		ITNACFEPAN
QMVKCDPRHG		KYMACCLLYR		GDVVPKDVNA		AIATIKTKRS		IQFVDWCPTG
FKVGINYQPP		TVVPGGDLAK		VQRAVCMLSN		TTAIAEAWAR		LDHKFDLMYA
KRAFVHWYVG		EGMEEGEFSE		AREDMAALEK		DYEEVGVDSV		EGEGEEEGEE
Y

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Білок має сайт для зв'язування з нуклеотидами, ГТФ. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті.

Література

• Cowan N.J., Dobner P., Fuchs E.V., Cleveland D.W. (1983). Expression of human alpha-tubulin genes: interspecies conservation of 3' untranslated regions. Mol. Cell. Biol. 3: 1738—1745. PMID 6646120 doi:10.1128/MCB.3.10.1738
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
• Baumann M.H., Wisniewski T., Levy E., Plant G.T., Ghiso J. (1996). C-terminal fragments of alpha- and beta-tubulin form amyloid fibrils in vitro and associate with amyloid deposits of familial cerebral amyloid angiopathy, British type. Biochem. Biophys. Res. Commun. 219: 238—242. PMID 8619814 doi:10.1006/bbrc.1996.0211
• Valenstein M.L., Roll-Mecak A. (2016). Graded control of microtubule severing by tubulin glutamylation. Cell. 164: 911—921. PMID 26875866 doi:10.1016/j.cell.2016.01.019
• Nirschl J.J., Magiera M.M., Lazarus J.E., Janke C., Holzbaur E.L. (2016). Alpha-tubulin tyrosination and CLIP-170 phosphorylation regulate the initiation of dynein-driven transport in neurons. Cell Rep. 14: 2637—2652. PMID 26972003 doi:10.1016/j.celrep.2016.02.046

Див. також

• Хромосома 12