BCAN

BCAN
Ідентифікатори
Символи	BCAN, BEHAB, CSPG7, Brevican
Зовнішні ІД	OMIM: 600347 MGI: 1096385 HomoloGene: 7244 GeneCards: BCAN
Онтологія гена Молекулярна функція • hyaluronic acid binding • carbohydrate binding • структурний компонент позаклітинного матриксу Клітинна компонента • мембрана • extracellular region • lysosomal lumen • Golgi lumen • anchored component of membrane • GO:0005578 позаклітинний матрикс • glutamatergic synapse Біологічний процес • skeletal system development • chondroitin sulfate biosynthetic process • extracellular matrix organization • central nervous system development • chondroitin sulfate catabolic process • dermatan sulfate biosynthetic process • hippocampus development • адгезія клітин • synapse maturation Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	63827	12032
Ensembl	ENSG00000132692	ENSMUSG00000004892
UniProt	Q96GW7	Q61361
RefSeq (мРНК)	NM_021948 NM_198427	NM_001109758 NM_007529
RefSeq (білок)	NP_068767 NP_940819	NP_001103228 NP_031555
Локус (UCSC)	Хр. 1: 156.64 – 156.66 Mb	Хр. 3: 87.99 – 88 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

BCAN (англ. Brevican) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 911 амінокислот, а молекулярна маса — 99 118.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAQLFLPLLA		ALVLAQAPAA		LADVLEGDSS		EDRAFRVRIA		GDAPLQGVLG
GALTIPCHVH		YLRPPPSRRA		VLGSPRVKWT		FLSRGREAEV		LVARGVRVKV
NEAYRFRVAL		PAYPASLTDV		SLALSELRPN		DSGIYRCEVQ		HGIDDSSDAV
EVKVKGVVFL		YREGSARYAF		SFSGAQEACA		RIGAHIATPE		QLYAAYLGGY
EQCDAGWLSD		QTVRYPIQTP		REACYGDMDG		FPGVRNYGVV		DPDDLYDVYC
YAEDLNGELF		LGDPPEKLTL		EEARAYCQER		GAEIATTGQL		YAAWDGGLDH
CSPGWLADGS		VRYPIVTPSQ		RCGGGLPGVK		TLFLFPNQTG		FPNKHSRFNV
YCFRDSAQPS		AIPEASNPAS		NPASDGLEAI		VTVTETLEEL		QLPQEATESE
SRGAIYSIPI		MEDGGGGSST		PEDPAEAPRT		LLEFETQSMV		PPTGFSEEEG
KALEEEEKYE		DEEEKEEEEE		EEEVEDEALW		AWPSELSSPG		PEASLPTEPA
AQEESLSQAP		ARAVLQPGAS		PLPDGESEAS		RPPRVHGPPT		ETLPTPRERN
LASPSPSTLV		EAREVGEATG		GPELSGVPRG		ESEETGSSEG		APSLLPATRA
PEGTRELEAP		SEDNSGRTAP		AGTSVQAQPV		LPTDSASRGG		VAVVPASGDC
VPSPCHNGGT		CLEEEEGVRC		LCLPGYGGDL		CDVGLRFCNP		GWDAFQGACY
KHFSTRRSWE		EAETQCRMYG		AHLASISTPE		EQDFINNRYR		EYQWIGLNDR
TIEGDFLWSD		GVPLLYENWN		PGQPDSYFLS		GENCVVMVWH		DQGQWSDVPC
NYHLSYTCKM		GLVSCGPPPE		LPLAQVFGRP		RLRYEVDTVL		RYRCREGLAQ
RNLPLIRCQE		NGRWEAPQIS		CVPRRPARAL		HPEEDPEGRQ		GRLLGRWKAL
LIPPSSPMPG		P

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з лектинами. Локалізований у мембрані, позаклітинному матриксі. Також секретований назовні.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 1