JARID2
| JARID2 | |
| Azonosítók | |
| Jel | JARID2 |
| Entrez | 3720 |
| OMIM | 601594 |
| RefSeq | NM_001267030 |
| UniProt | Q92833 |
| PDB | 5HYN |
| GeneCards | JARID2 |
| Egyéb adatok | |
| Lokusz | 6. krom. p22.3 |
A jumonji fehérje a JARID2 gén által kódolt fehérje.[1][2] A JARID2 az α-ketoglutarát-dependens hidroxilázok szupercsaládjának tagja.
A JARID2 (jumonji, AT rich interactive domain 2) lehetséges transzkripciós faktor. Az egér-embriogenezishez szükséges magi fehérjeként a jumonji család egyik DNS-kötő AT-gazdag szakasszal kölcsönható domént (ARID) tartalmazó tagja.[3][4][5][6] In vitro tanulmányozása igazolta, hogy az ARID és más domének DNS-kötésben, magi elhelyezkedésben, transzkripciórepresszióban[7] és a Polycomb represszív komplex 2 (PRC2) aktiválásában játszanak szerepet.[8][9] Az ezeket okozó sejtbeli mechanizmusok nagyrészt ismeretlenek.
A fejlődésben fontos gének keresése során géncsapda-technológiával azonosították az organogenezis egy fontos tényezőjeként.[3][7][10] Az egér organogenezise során a JARID2 az idegcső kialakulásában és a máj, a lép, a csecsemőmirigy és a kardiovaszkuláris rendszer fejlődésében játszik szerepet.[11][12] A szív szöveteiben történő folyamatos JARID2-expresszió igazolja az embrionális és a felnőtt szív fejlődésében egyaránt fontos szerepét.[3] A mutáns JARID2-vel rendelkező embriók súlyos szívdeformációkat, például kamrafali hiányosságokat, kamrafal-összehúzódási hiányosságokat és pitvarmegnagyobbodást mutatnak.[3] A homozigóta Jarid2-mutánsok születés után kevéssel halnak.[3] A JARID2 túlexpressziója represszálja a szívizomsejt-szaporodást egy fő sejtciklusszabályzó fehérjével, a retinoblasztómafehérjével (Rb) való közeli kölcsönhatással.[7][10][13] A retinoblasztómakötő fehérje 2 és az SMCX egérben és emberben előforduló változatai több homológ régióval rendelkeznek.[1]
Funkció
[szerkesztés | forrásszöveg szerkesztése]A PRC2 aktiválását és a hisztonmetilációt szabályozza a TGF-β-n keresztül.[14] Ezenkívül nem kódoló RNS-ekhez is kapcsolódik egy 30 aminosavból álló szakasz révén, melyek stimulálják kölcsönhatását a PRC2-vel, illetve annak katalitikus részével, az EZH2-vel.[15]
A hisztonok transzláció utáni módosításai és a PRC2-aktiváció közti kapcsolatot mediálja, felismeri a H2A hiszton 119. helyen lévő aminosavjának és a H2A és H2B hisztonban közös savas részlet ubikvitinációját is.[16] Ebben kofaktora az AEBP2.[16]
Humán embrionális őssejtekben a JARID2 pluripotenciamarker, és szükséges a 2iL-I-F állapot fenntartásához, bár az azt megelőző 5iLA állapotban kevéssé expresszálódik.[17]
Klinikai jelentőség
[szerkesztés | forrásszöveg szerkesztése]A TGF-β által indukált epitél–mezenchimális átmenettel kapcsolatos gének változásait növelni tudja.[14] A PRC2 aktivációja révén szabályozza a vérképző őssejtek funkcióját is.[18]
Átültetésekben
[szerkesztés | forrásszöveg szerkesztése]A JARID2 knockdownja növeli a lehetőséget emberekből és egerekből származó vérképző ős- és progenitor sejtek átültetésére egyaránt. E hatást Kinkel et al. 2015-ben a SUZ12-knockdownhoz hasonlónak találták.[18]
Betegségekben
[szerkesztés | forrásszöveg szerkesztése]A JARID2 haploinszufficienciája az értelmi fogyatékosság egyik oka lehet.[19]
Jegyzetek
[szerkesztés | forrásszöveg szerkesztése]- 1 2 Berge-Lefranc JL, Jay P, Massacrier A, Cau P, Mattei MG, Bauer S, Marsollier C, Berta P, Fontes M (1997. február). "Characterization of the human jumonji gene". Hum Mol Genet. 5 (10): 1637–41. doi:10.1093/hmg/5.10.1637. PMID 8894700.
{{cite journal}}: CS1 karbantartás: több név: szerzőfelsorolás (link) - ↑ "Entrez Gene: JARID2 jumonji, AT rich interactive domain 2".
- 1 2 3 4 5 Kim TG, Kraus JC, Chen J, Lee Y (2004). "Jumonji, a critical factor for cardiac development, functions as a transcriptional repressor". J. Biol. Chem. 278 (43): 42247–55. doi:10.1074/jbc.M307386200. PMID 12890668.
{{cite journal}}: CS1 karbantartás: több név: szerzőfelsorolás (link) - ↑ Mysliwiec MR, Kim TG, Lee Y (2007). "Characterization of zinc finger protein 496 that interacts with jumonji/jarid2". FEBS Letters. 581 (14): 2633–2640. Bibcode:2007FEBSL.581.2633M. doi:10.1016/j.febslet.2007.05.006. PMC 2002548. PMID 17521633.
{{cite journal}}: CS1 karbantartás: több név: szerzőfelsorolás (link) - ↑ Takahashi M, Kojima M, Nakajima K, Suzuki-Migishima R, Motegi Y, Yokoyama M, Takeuchi, T (2004). "Cardiac abnormalities cause early lethality of jumonji mutant mice". Biochemical and Biophysical Research Communications. 324 (4): 1319–23. Bibcode:2004BBRC..324.1319T. doi:10.1016/j.bbrc.2004.09.203. PMID 15504358.
{{cite journal}}: CS1 karbantartás: több név: szerzőfelsorolás (link) - ↑ Toyoda M, Kojima M, Takeuchi T (2000). "Jumonji is a nuclear protein that participates in the negative regulation of cell growth". Biochemical and Biophysical Research Communications. 274 (2): 332–336. Bibcode:2000BBRC..274..332T. doi:10.1006/bbrc.2000.3138. PMID 10913339.
{{cite journal}}: CS1 karbantartás: több név: szerzőfelsorolás (link) - 1 2 3 Klassen SS, Rabkin SW (2008). "Nitric oxide induces gene expression of jumonji and retinoblastoma 2 protein while reducing expression of atrial natriuretic peptide precursor type B in cardiomyocytes". Folia Biologica. 54 (2): 65–70. doi:10.14712/fb2008054020065. PMID 18498724.
- ↑ Pasini D, Cloos PA, Walfridsson J, Olsson L, Bukowski JP, Johansen JV, Helin K (2010). "JARID2 regulates binding of the polycomb repressive complex 2 to target genes in ES cells". Nature. 464 (7286): 306–310. Bibcode:2010Natur.464..306P. doi:10.1038/nature08788. PMID 20075857. S2CID 205219740.
{{cite journal}}: CS1 karbantartás: több név: szerzőfelsorolás (link) - ↑ Son J, Shen SS, Margueron R, Reinberg D (2013). "Nucleosome-binding activities within JARID2 and EZH1 regulate the function of PRC2 on chromatin". Genes & Development. 27 (24): 2663–77. doi:10.1101/gad.225888.113. PMC 3877756. PMID 24352422.
{{cite journal}}: CS1 karbantartás: több név: szerzőfelsorolás (link) - 1 2 Jung J, Mysliwiec MR, Lee Y (2005). "Roles of Jumonji in mouse embryonic development". Developmental Dynamics. 232 (1): 21–32. doi:10.1002/dvdy.20204. PMID 15580614. S2CID 31338749.
{{cite journal}}: CS1 karbantartás: több név: szerzőfelsorolás (link) - ↑ Motoyama J, Kitajima K, Kojima M, Kondo S, Takeuchi T (1997). "Organogenesis of the liver, thymus and spleen is affected in jumonji mutant mice". Mechanisms of Development. 66 (1–2): 27–37. doi:10.1016/s0925-4773(97)00082-8. PMID 9376320. S2CID 6531281.
{{cite journal}}: CS1 karbantartás: több név: szerzőfelsorolás (link) - ↑ Takeuchi T, Yamazaki Y, Katoh-Fukui Y, Tsuchiya R, Kondo S, Motoyama J, Higashinakagawa T (1995). "Gene trap capture of a novel mouse gene, jumonji, required for neural tube formation". Genes & Development. 9 (10): 1211–22. doi:10.1101/gad.9.10.1211. PMID 7758946.
{{cite journal}}: CS1 karbantartás: több név: szerzőfelsorolás (link) - ↑ Mysliwiec MR, Chen J, Powers PA, Bartley CR, Schneider MD, Lee Y (2000). "Generation of a conditional null allele of jumonji". Genesis. 44 (9): 407–11. doi:10.1002/dvg.20221. PMC 2002517. PMID 16900512.
{{cite journal}}: CS1 karbantartás: több név: szerzőfelsorolás (link) - 1 2 Tange S, Oktyabri D, Terashima M, Ishimura A, Suzuki T (2014. december 26.). "JARID2 is involved in transforming growth factor-beta-induced epithelial-mesenchymal transition of lung and colon cancer cell lines". PLoS One. 9 (12): e115684. doi:10.1371/journal.pone.0115684. PMC 4277293. PMID 25542019. Hozzáférés: 2026. január 20.
{{cite journal}}: CS1 karbantartás: jelöletlen szabad DOI (link) CS1 karbantartás: oldalszám helyett cikk száma (link) CS1 karbantartás: több név: szerzőfelsorolás (link) - ↑ Kaneko S, Bonasio R, Saldaña-Meyer R, Yoshida T, Son J, Nishino K, Umezawa A, Reinberg D (2014. január 23.). "Interactions between JARID2 and noncoding RNAs regulate PRC2 recruitment to chromatin". Mol Cell. 53 (2): 290–300. doi:10.1016/j.molcel.2013.11.012. PMC 4026005. PMID 24374312. Hozzáférés: 2026. január 20.
{{cite journal}}: CS1 karbantartás: több név: szerzőfelsorolás (link) - 1 2 Kasinath V, Beck C, Sauer P, Poepsel S, Kosmatka J, Faini M, Toso D, Aebersold R, Nogales E (2021. január 22.). "JARID2 and AEBP2 regulate PRC2 in the presence of H2AK119ub1 and other histone modifications". Science. 371 (6527): eabc3393. doi:10.1126/science.abc3393. PMC 7993630. PMID 33479123.
{{cite journal}}: CS1 karbantartás: oldalszám helyett cikk száma (link) CS1 karbantartás: több név: szerzőfelsorolás (link) - ↑ Ferreccio A, Mathieu J, Detraux D, Somasundaram L, Cavanaugh C, Sopher B, Fischer K, Bello T, M Hussein A, Levy S, Cook S, Sidhu SB, Artoni F, Palpant NJ, Reinecke H, Wang Y, Paddison P, Murry C, Jayadev S, Ware C, Ruohola-Baker H (2018. április 5.). "Inducible CRISPR genome editing platform in naive human embryonic stem cells reveals JARID2 function in self-renewal". Cell Cycle. 17 (5): 535–549. doi:10.1080/15384101.2018.1442621. PMC 5969550. PMID 29466914.
{{cite journal}}: CS1 karbantartás: több név: szerzőfelsorolás (link) - 1 2 Kinkel SA, Galeev R, Flensburg C, Keniry A, Breslin K, Gilan O, Lee S, Liu J, Chen K, Gearing LJ, Moore DL, Alexander WS, Dawson M, Majewski IJ, Oshlack A, Larsson J, Blewitt ME (2015. március 19.). "Jarid2 regulates hematopoietic stem cell function by acting with polycomb repressive complex 2". Blood. 125 (12): 1890–1900. doi:10.1182/blood-2014-10-603969. PMC 4424268. PMID 25645357. Hozzáférés: 2026. január 20.
{{cite journal}}: CS1 karbantartás: több név: szerzőfelsorolás (link) - ↑ Barøy T, Misceo D, Strømme P, Stray-Pedersen A, Holmgren A, Rødningen OK, Blomhoff A, Helle JR, Stormyr A, Tvedt B, Fannemel M, Frengen E (2013. január 7.). "Haploinsufficiency of two histone modifier genes on 6p22.3, ATXN1 and JARID2, is associated with intellectual disability". Orphanet J Rare Dis. 8: 3. doi:10.1186/1750-1172-8-3. PMC 3675438. PMID 23294540. Hozzáférés: 2026. január 20.
{{cite journal}}: CS1 karbantartás: jelöletlen szabad DOI (link) CS1 karbantartás: több név: szerzőfelsorolás (link)
Fordítás
[szerkesztés | forrásszöveg szerkesztése]Ez a szócikk részben vagy egészben a JARID2 című angol Wikipédia-szócikk ezen változatának fordításán alapul. Az eredeti cikk szerkesztőit annak laptörténete sorolja fel. Ez a jelzés csupán a megfogalmazás eredetét és a szerzői jogokat jelzi, nem szolgál a cikkben szereplő információk forrásmegjelöléseként.
További információk
[szerkesztés | forrásszöveg szerkesztése]- Lee Y, Song AJ, Baker R; et al. (2000). "Jumonji, a nuclear protein that is necessary for normal heart development". Circ. Res. 86 (9): 932–8. doi:10.1161/01.res.86.9.932. PMID 10807864.
{{cite journal}}: Explicit use of et al. in:|author=(súgó)CS1 karbantartás: több név: szerzőfelsorolás (link) - Toyoda M, Kojima M, Takeuchi T (2000). "Jumonji is a nuclear protein that participates in the negative regulation of cell growth". Biochem. Biophys. Res. Commun. 274 (2): 332–6. Bibcode:2000BBRC..274..332T. doi:10.1006/bbrc.2000.3138. PMID 10913339.
{{cite journal}}: CS1 karbantartás: több név: szerzőfelsorolás (link) - Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH; et al. (2003). "Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002PNAS...9916899M. doi:10.1073/pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
{{cite journal}}: Explicit use of et al. in:|author=(súgó)CS1 karbantartás: több név: szerzőfelsorolás (link) - Mungall AJ, Palmer SA, Sims SK; et al. (2003). "The DNA sequence and analysis of human chromosome 6". Nature. 425 (6960): 805–811. Bibcode:2003Natur.425..805M. doi:10.1038/nature02055. PMID 14574404.
{{cite journal}}: Explicit use of et al. in:|author=(súgó)CS1 karbantartás: több név: szerzőfelsorolás (link) - Volcik KA, Zhu H, Finnell RH; et al. (2004). "Evaluation of the jumonji gene and risk for spina bifida and congenital heart defects". Am. J. Med. Genet. A. 126 (2): 215–7. doi:10.1002/ajmg.a.20574. PMID 15057990. S2CID 221248186.
{{cite journal}}: Explicit use of et al. in:|author=(súgó)CS1 karbantartás: több név: szerzőfelsorolás (link) - Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA; et al. (2004). "The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC)". Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
{{cite journal}}: Explicit use of et al. in:|author=(súgó)CS1 karbantartás: több név: szerzőfelsorolás (link) - Kim TG, Chen J, Sadoshima J, Lee Y (2005). "Jumonji represses atrial natriuretic factor gene expression by inhibiting transcriptional activities of cardiac transcription factors". Mol. Cell. Biol. 24 (23): 10151–60. doi:10.1128/MCB.24.23.10151-10160.2004. PMC 529025. PMID 15542826.
{{cite journal}}: CS1 karbantartás: több név: szerzőfelsorolás (link) - Pedrosa E, Ye K, Nolan KA; et al. (2007). "Positive association of schizophrenia to JARID2 gene". Am. J. Med. Genet. B Neuropsychiatr. Genet. 144 (1): 45–51. doi:10.1002/ajmg.b.30386. PMID 16967465. S2CID 25560999.
{{cite journal}}: Explicit use of et al. in:|author=(súgó)CS1 karbantartás: több név: szerzőfelsorolás (link) - JARID2+protein,+human a U.S. National Library of Medicine Medical Subject Headings (MeSH) honlapján
