weixin_41772125
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【多重好礼】鸿蒙心迹 · 开发录原创征稿活动

鸿蒙开发者的实战经验,值得被记录。从踩坑排查到项目复盘,从工具脚本到学习笔记,每一段真实的开发经历,都是社区最宝贵的技术资产。「鸿蒙心迹 · 开发录」正式启航,不限主题、随时可写,只要是鸿蒙开发相关的真实经验都欢迎投稿。 本活动为 [HarmonyOS 7.0 创新内容共创季](https://builderx.csdn.net/activity-site/harmonyos/activity2026)双轨征文之一,与[「共创季 · 稿事节」](https://harmonyosdev.csdn.net/6a97f0de2b83d06f0ecadec5.html)深度征文互补——「稿事节」写深度技术长文,「开发录」写日常开发实战笔记。 「开发录」每月一期,12月截止,本季共三期,投稿即有机会获得京东卡、CSDN博客流量券、亿万Token、社区定制周边好礼!

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【数据下载】 NCBI SRR 数据下载

最后在https://ftp.sra.ebi.ac.uk/vol1/fastq/SRR283/087/SRR28305187/ 网站上直接找到了原始下载链接。后续需要下载可以直接根据ID来这个网站上找一找。能直接下载的只有SRA和SRA Lite 格式的,但需要依赖SRA tools 来转换,同时还需要ncbi certificate。有些SRA数据的数据没有提供原始数据fq.gz的下载链接,显示存在aws云上,好不容易建立了aws账户和bucket,ncbi又说我的bucket未开放授权。
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博文更新于 2025.07.31 ·
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yaml里的想要加入逗号“,”如何处理

当我想要用yaml加入含有逗号“,”的参数时, 逗号会自动变成空格。
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博文更新于 2024.01.25 ·
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【生信笔记】eigenstrat convert to vcf format

eigenstrat vcf plink 三种文件转换
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博文更新于 2023.03.01 ·
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R 添加使用mac字体

R 添加mac字体#安装,加载showtext包> install.packages(showtext)> library(showtext)# 查看R已安装字体> font_families()[1] "sans" "serif" "mono" "wqy-microhei"发现只要少数几个字体,如果我们想使用mac系统已有字体,比如Times New Roman,可以从/System/Library/Fonts/ 中找到l
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博文更新于 2022.01.28 ·
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下载外网大文件神器 mac window 都行

工具地址:Neat Download Manager for Mac and Windows (Free Internet Download Manager Mac & Windows )setting那里把segments改到最大 32直接New URL那里填要下载的文件网址14G的大文件下载时间从2天缩短到2小时mac用户注意自己存储余量。。 需要的存储是下载文件的2倍以上,要不然会merge失败喔...
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博文更新于 2021.09.24 ·
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【linux】一些我经常忘记但是很有用的Linux技巧,持续更新

1.vi 多行注释与取消:注释步骤:-》“Esc”键->-》"Ctrl + v" -》-》I -》-》注释取消:esc -》 Ctrl + v -》光标移动选定要取消注释的行 -》按下“x”或者“d”2.shell 变量嵌套HG001=/ftp-trace.ncbi.nih.gov/giab/ftp/release/NA12878_HG001/latest/GRCh38/HG001_GRCh38_GIAB_highconf_CG-IllFB-IllGATKHC-Io...
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博文更新于 2021.02.04 ·
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【R】R画图不显示中文问题

系统mac os 11RstutioVersion1.2.1335RVersion3.6.2画图里的中文一直显示成方框。ggplot()+geom_point(aes(x=ta1$X2011年,y=ta1$X2012))+ xlab("2011年")+ylab("2021年")解决方案:使用showtext。install.packages("showtext", repos = "https://mirrors.ustc.edu.cn/CRAN/")in...
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博文更新于 2021.01.06 ·
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【perl】perl 同时读取2个文件

perl 读取两个相同列的文件perl 读取两个相同列的文件,进行一对应列的计算。可以使用hash,但文件很大的时候不太适用,因为hash占内存很大。$cat A.file.txtname numA 22B 33$cat B.file.txtname numA 11B 23open(f1, "<data1");open(f2, "<data2");# initialize hashes%data1 = ();%data2 = ();while(($li.
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博文更新于 2020.11.02 ·
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【生信分析笔记】GATK GenotypeConcordance:Sequence dictionaries are not the same size (25, 195)

分析时需要将数据与GIAB金标准集进行比较,GenotypeConcordance有报错:my script:time /gatk/4.1.7.0/gatk GenotypeConcordance \--CALL_VCF myvcf.gz \--TRUTH_VCF /GIAB/ftp-trace.ncbi.nih.gov/giab/ftp/release/AshkenazimTrio/HG002_NA24385_son/latest/GRCh38/HG002_GRCh38_GIAB_highco
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博文更新于 2020.10.29 ·
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【生信笔记】gvcf 和 vcf文件中的星号 * 是啥意思

分析的时候ALT中出现了*,(如下)懵逼。#CHROM POS ID REF ALT QUAL FILTER INFO FORMATchr9 10105 rs575580161 C *,A 180.66 VQSRTrancheSNP99.50to99.90 AC=3,2;AF=1.280e-03,8.532e-4;AN=2344;DB;DP=1886;ExcessHet=0;FS=0;InbreedingCoeff=0.331;MQ=40.98;NEGATIVE_TRAIN_SITE;PG=0,28
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博文更新于 2020.10.29 ·
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